Resumo A abordagem molecular para identificação de espécies desconhecidas usando o gene citocromo b é eficaz e confiável em comparação com a identificação baseada na morfologia. Códigos de barras de DNA de genes moleculares universais foram usados para identificar as espécies. O citocromo b é um gene específico usado para fins de identificação. O código de barras de DNA é um método confiável e eficaz em comparação com os diferentes métodos morfológicos tradicionais de identificação de espécies. Assim, no presente estudo, que foi realizado para identificar as espécies, um total de 50 amostras de peixes foram coletadas em cinco locais diferentes. O DNA foi extraído usando o método Fenol Clorofórmio do tecido muscular. Cinco sequências foram sequenciadas (uma de cada local), analisadas e identificadas espécies específicas, como Pangasius pangasius. As sequências identificadas tinham comprimento variável de 369 bp (Local 1), 364 bp (Local 2), 369 bp (Local 1), 364 bp (Local 3), 352 bp (Local 4) e 334 bp (Local 5). As correspondências de identidade no banco de dados do NCBI confirmaram a espécie específica como P. pangasius. Uma árvore de distanciamento foi desenhada para mostrar a máxima probabilidade entre elas e diferentes espécies. No entanto, em muitos casos, peixes em diversos estágios de desenvolvimento são difíceis de identificar por caracteres morfológicos. Os métodos de identificação baseados em DNA oferecem uma adição analiticamente poderosa ou mesmo uma ferramenta alternativa para identificação de espécies e estudo filogenético. Este trabalho pretende fornecer uma visão geral atualizada e abrangente sobre os métodos baseados em DNA para identificação de espécies de peixes usando o gene citocromo b como marcadores direcionados para fins de identificação.

Abstract Molecular appraoch for identification of unknown species by using Cytochrome b gene is an effective and reliable as compared with morphological based identification. For DNA barcoding universal molecular genes were used to identify the species. Cytochrome b is a specific gene used for identification purpose. DNA barcoding is a reliable and effective method compared to the different traditional morphological methods of specie identification. So,in the present study which was conducted to identify the species, a total of 50 fish samples were collected from five different sites. DNA was extracted by using the Phenol Chloroform method from muscle tissue. Five sequences were sequenced (one from each site), analyzed, and identified specific species as Pangasius pangasius. Identified sequences were variable in length from 369 bp (Site 1), 364 bp (Site 2), 364 bp (Site 3), 352 bp (Site 4), and 334 bp (Site 5). Identity matches on the NCBI database confirmed the specific specie as P. pangasius. A distancing tree was drawn to show maximum likelihood among the same and different species. Yet, in many cases fishes on diverse development stages are difficult to identify by morphological characters. DNA-based identification methods offer an analytically powerful addition or even an alternative tool for species identification and phylogenetic study. This work intends to provide an updated and extensive overview on the DNA based methods for fish species identification by using Cytochrome b gene as targeted markers for identification purpose.

Resumo O presente estudo foi realizado em Hayat Abad Industrial Estate, localizado em Peshawar, para avaliar os níveis de cádmio (Cd) que estavam presentes no solo, bem como nas partes da planta (raízes e brotos). Para avaliar o potencial de fitorremediação das plantas foram determinados diferentes fatores, ou seja, Fator de Bioconcentração (BCF), Fator de Translocação (TF) e Coeficiente de Bioacumulação. Essas plantas foram cultivadas em seus habitats nativos (BAC). Analisamos a concentração de cádmio do solo coletada em 50 locais diferentes, variando de 11,54 mg/Kg (o mais baixo) a 89,80 mg/Kg (o mais alto). A concentração máxima (89,80 mg/Kg) de cádmio foi encontrada em HIE-ST-16L Marble City e HIE-ST-7 Bryon Pharma (88,51 mg/Kg) enquanto sua concentração mínima (12,47 mg/Kg) foi detectada no solo do local (HIE-ST-14L Royal PVC Pipe) e (11,54 mg/Kg) no local (HIE-ST-11 Aries Pharma). A maioria das espécies de plantas mostrou um enorme potencial para abordagens baseadas em plantas, como fitoextração e fitorremediação. Eles também mostraram o potencial de fitoestabilização. Com base na concentração de cádmio, as plantas mais eficientes para fitoextração foram Cnicus benedictus, Parthenium hysterophorus, Verbesina encelioides, Conyza canadensis, Xanthium strumarium, Chenopodium album, Amaranthus viridis, Chenopodiastrum murale, Prosopis juliflora, Convolvulus arvensis, Stellaria media, Arenaria serpyllifolia, Cerastium dichotomum, Chrozophora tinctoria, Mirabilis jalapa, Medicago polymorpha, Lathyrus aphaca, Dalbergia sissoo, Melilotus indicus e Anagallis arvensis. Os metais pesados de cádmio no solo examinado foram efetivamente removidos por essas espécies de plantas. Cerastium dichotomum e Chenopodium murale foram relatados como eficazes na fitoestabilização do Cd com base nas concentrações de metais selecionados nas raízes e nos valores de BCFs, TFs e BACs.

Abstract The present study was carried out in Hayat Abad Industrial Estate located in Peshawar to assess the levels of cadmium (Cd) that were present in the soil as well as the plant parts (Roots and shoots). To evaluate the phytoremediation potential of the plants different factors i.e. Bioconcentration Factor (BCF), Translocation Factor (TF), and Bioaccumulation Coefficient were determined. These plants were grown in their native habitats (BAC). We have analysed, cadmium concentration from soil which are collected from 50 different locations ranged from 11.54 mg/Kg (the lowest) to 89.80 mg/Kg (highest). The maximum concentration (89.80 mg/Kg) of cadmium was found in HIE-ST-16L Marble City and HIE-ST-7 Bryon Pharma (88.51 mg/Kg) while its minimum concentration (12.47 mg/Kg) were detected in the soil of Site (HIE-ST-14L Royal PVC Pipe) and (11.54 mg/Kg) at the site (HIE-ST-11 Aries Pharma). Most plant species showed huge potential for plant based approaches like phyto-extraction and phytoremediation. They also showed the potential for phyto-stabilization as well. Based on the concentration of cadmium the most efficient plants for phytoextraction were Cnicus benedictus, Parthenium hysterophorus, Verbesina encelioides, Conyza canadensis, Xanthium strumarium, Chenopodium album, Amaranthus viridis, Chenopodiastrum murale, Prosopis juliflora, Convolvulus arvensis, Stellaria media, Arenaria serpyllifolia, Cerastium dichotomum, Chrozophora tinctoria, Mirabilis jalapa, Medicago polymorpha, Lathyrus aphaca, Dalbergia sissoo, Melilotus indicus and Anagallis arvensis. The cadmium heavy metals in the examined soil were effectively removed by these plant species. Cerastium dichotomum, and Chenopodium murale were reported to be effective in phyto-stabilizing Cd based on concentrations of selected metals in roots and BCFs, TFs, and BACs values.

Resumo A seca é um dos estresses abióticos mais prejudiciais que dificultam o crescimento e o desenvolvimento das plantas. O presente estudo teve como objetivo determinar os efeitos de vários quocientes de Ca/Mg sob estresse osmótico induzido por polietilenoglicol (PEG) no crescimento, absorção e translocação de Ca e Mg em Avena sativa L. As plantas foram cultivadas em solução nutritiva suplementada com três diferentes quocientes molares de Ca/Mg (0,18, 2 e 4). Após 30 dias, as plantas foram expostas a duas concentrações diferentes de PEG (0,6 MPa e 0,2 MPa) por 8 dias, e as soluções foram renovadas após 4 dias. Uma solução contendo os nutrientes Ca e Mg mitigou o impacto negativo causado por estresse osmótico na taxa de crescimento relativo (RGR), taxa de crescimento absoluto (AGR), taxa de crescimento da cultura (CGR), razão de área foliar (LAR), razão de índice foliar (LAI), razão raiz-parte aérea (RSR), eficiência do uso da água (WUE) e taxa de assimilação líquida (NAR). Além disso, afetou negativamente os parâmetros de germinação, incluindo porcentagem final de emergência (FEP), tempo médio de germinação (MGT), índice de germinação de Timson (TGI), índice de taxa de germinação (GRI) e capacidade de campo percentual (%FC) de aveia (Avena sativa L.). O Mg e o Ca na parte aérea e raiz e o fator de translocação de Ca diminuíram com o aumento de Ca em solução, enquanto o fator de translocação de Mg aumentou com o aumento de Ca em solução nutritiva. Neste trabalho, são examinados os efeitos combinados de vários quocientes de Ca/Mg e estresse osmótico produzido por PEG em diferentes concentrações (0,6 MPa e 0,2 MPa) no crescimento e na absorção de elementos de Avena sativa L. Como resultado, o quociente de Ca/Mg pode combater naturalmente o estresse hídrico moderado experimentado pelas lavouras.

Abstract Drought is one of the most damaging abiotic stress that hinder plant growth and development. The present study aimed to determine the effects of various Ca/Mg quotients under polyethylene glycol (PEG)–induced osmotic stress on growth, uptake and translocation of Ca and Mg in Avena sativa (L). Plants were grown in nutrient solution supplemented with three different Ca/Mg molar quotients (0.18, 2, and 4). After 30 days plants were exposed to two different PEG (Polyethylene glycol) concentrations (0.6 MPa & 0.2 MPa) for 8 days, and solutions were renewed after 4 days. A solution containing Ca and Mg nutrients has mitigated the negative impact caused via osmotic stress on relative growth rate (RGR), absolute growth rate (AGR), crop growth rate (CGR), leaf area ratio (LAR), Leaf index ratio (LAI), root-shoot ratio (RSR), water use efficiency (WUE) and net assimilation rate (NAR). In addition, it adversely affected germination parameters, including final emergence percentage (FEP), mean germination time (MGT), Timson germination Index (TGI), germination rate index (GRI) and percent field capacity (%FC), of oat (Avena sativa L.). Mg and Ca in shoot and root and Ca translocation factor decreased with increasing Ca in solution, while Mg translocation factor increased with increasing Ca in nutrient solution. In this work, the combined effects of various Ca/Mg quotients and osmotic stress produced by polyethylene glycol (PEG) in different concentrations (0.6 MPa, 0.2 MPa) on the growth and element uptake of Avena sativa L. are examined. As a result, the Ca/Mg Quotient may naturally combat the moderate drought stress experienced by field crops.